Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSDMDP57764 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GSDMDP57764 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GSDMDP57764 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GSDMDP57764 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSDMDP57764 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMDP57764 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMDP57764 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms