Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN12P56749 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN12P56749 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN12P56749 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN12P56749 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN12P56749 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms