Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EIF3BP55884 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF3BP55884 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF3BP55884 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF3BP55884 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF3BP55884 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF3BP55884 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms