Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN3P54252 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATXN3P54252 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATXN3P54252 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN3P54252 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN3P54252 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms