Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A1P53007 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A1P53007 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A1P53007 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A1P53007 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A1P53007 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A1P53007 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms