Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK3P51956 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK3P51956 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK3P51956 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK3P51956 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK3P51956 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK3P51956 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK3P51956 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK3P51956 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK3P51956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK3P51956 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK3P51956 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK3P51956 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK3P51956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK3P51956 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK3P51956 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK3P51956 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK3P51956 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK3P51956 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK3P51956 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEK3P51956 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK3P51956 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK3P51956 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK3P51956 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK3P51956 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK3P51956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEK3P51956 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK3P51956 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK3P51956 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK3P51956 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK3P51956 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK3P51956 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK3P51956 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK3P51956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK3P51956 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK3P51956 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK3P51956 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK3P51956 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK3P51956 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK3P51956 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK3P51956 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK3P51956 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEK3P51956 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK3P51956 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK3P51956 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK3P51956 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK3P51956 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK3P51956 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK3P51956 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK3P51956 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK3P51956 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK3P51956 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK3P51956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK3P51956 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK3P51956 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK3P51956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK3P51956 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK3P51956 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK3P51956 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK3P51956 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK3P51956 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK3P51956 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK3P51956 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK3P51956 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK3P51956 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK3P51956 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK3P51956 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK3P51956 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK3P51956 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK3P51956 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK3P51956 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK3P51956 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK3P51956 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK3P51956 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK3P51956 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK3P51956 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK3P51956 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK3P51956 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK3P51956 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK3P51956 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms