Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC3P51654 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC3P51654 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC3P51654 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC3P51654 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC3P51654 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC3P51654 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC3P51654 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC3P51654 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC3P51654 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC3P51654 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC3P51654 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC3P51654 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC3P51654 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC3P51654 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC3P51654 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC3P51654 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC3P51654 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC3P51654 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC3P51654 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC3P51654 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC3P51654 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC3P51654 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC3P51654 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC3P51654 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPC3P51654 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPC3P51654 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC3P51654 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC3P51654 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC3P51654 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC3P51654 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC3P51654 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC3P51654 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC3P51654 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC3P51654 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC3P51654 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPC3P51654 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPC3P51654 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC3P51654 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC3P51654 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC3P51654 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPC3P51654 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPC3P51654 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPC3P51654 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC3P51654 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC3P51654 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPC3P51654 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC3P51654 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC3P51654 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC3P51654 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC3P51654 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC3P51654 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC3P51654 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC3P51654 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC3P51654 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC3P51654 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC3P51654 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC3P51654 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC3P51654 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC3P51654 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC3P51654 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC3P51654 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC3P51654 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC3P51654 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPC3P51654 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC3P51654 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC3P51654 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC3P51654 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC3P51654 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC3P51654 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC3P51654 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC3P51654 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC3P51654 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPC3P51654 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPC3P51654 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC3P51654 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC3P51654 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC3P51654 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC3P51654 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC3P51654 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC3P51654 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC3P51654 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC3P51654 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC3P51654 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC3P51654 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPC3P51654 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPC3P51654 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC3P51654 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GPC3P51654 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPC3P51654 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC3P51654 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC3P51654 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC3P51654 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC3P51654 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC3P51654 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC3P51654 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPC3P51654 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC3P51654 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC3P51654 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC3P51654 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.9 ms