Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLCSP50747 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLCSP50747 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HLCSP50747 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLCSP50747 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLCSP50747 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLCSP50747 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLCSP50747 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLCSP50747 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLCSP50747 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLCSP50747 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLCSP50747 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLCSP50747 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLCSP50747 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLCSP50747 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLCSP50747 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLCSP50747 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLCSP50747 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLCSP50747 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLCSP50747 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLCSP50747 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLCSP50747 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLCSP50747 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLCSP50747 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLCSP50747 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLCSP50747 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLCSP50747 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLCSP50747 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLCSP50747 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLCSP50747 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLCSP50747 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLCSP50747 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLCSP50747 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLCSP50747 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLCSP50747 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLCSP50747 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLCSP50747 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLCSP50747 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLCSP50747 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLCSP50747 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HLCSP50747 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLCSP50747 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLCSP50747 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLCSP50747 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLCSP50747 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HLCSP50747 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLCSP50747 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLCSP50747 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLCSP50747 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLCSP50747 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLCSP50747 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLCSP50747 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HLCSP50747 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLCSP50747 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLCSP50747 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLCSP50747 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLCSP50747 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLCSP50747 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLCSP50747 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLCSP50747 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLCSP50747 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLCSP50747 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLCSP50747 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLCSP50747 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLCSP50747 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLCSP50747 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLCSP50747 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLCSP50747 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLCSP50747 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLCSP50747 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLCSP50747 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLCSP50747 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLCSP50747 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLCSP50747 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLCSP50747 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLCSP50747 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLCSP50747 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLCSP50747 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLCSP50747 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLCSP50747 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLCSP50747 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLCSP50747 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLCSP50747 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLCSP50747 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLCSP50747 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLCSP50747 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLCSP50747 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLCSP50747 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLCSP50747 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLCSP50747 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLCSP50747 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLCSP50747 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLCSP50747 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLCSP50747 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms