Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX5P50542 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PEX5P50542 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PEX5P50542 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX5P50542 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX5P50542 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX5P50542 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX5P50542 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX5P50542 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PEX5P50542 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX5P50542 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX5P50542 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX5P50542 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PEX5P50542 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PEX5P50542 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PEX5P50542 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX5P50542 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PEX5P50542 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PEX5P50542 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PEX5P50542 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX5P50542 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX5P50542 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PEX5P50542 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PEX5P50542 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX5P50542 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PEX5P50542 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PEX5P50542 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PEX5P50542 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PEX5P50542 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PEX5P50542 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PEX5P50542 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PEX5P50542 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX5P50542 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX5P50542 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX5P50542 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX5P50542 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX5P50542 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX5P50542 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX5P50542 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX5P50542 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX5P50542 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX5P50542 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX5P50542 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX5P50542 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PEX5P50542 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PEX5P50542 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX5P50542 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX5P50542 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX5P50542 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX5P50542 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX5P50542 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX5P50542 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PEX5P50542 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PEX5P50542 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX5P50542 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX5P50542 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX5P50542 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PEX5P50542 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PEX5P50542 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PEX5P50542 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PEX5P50542 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX5P50542 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX5P50542 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX5P50542 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PEX5P50542 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PEX5P50542 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PEX5P50542 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX5P50542 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX5P50542 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX5P50542 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX5P50542 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX5P50542 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX5P50542 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX5P50542 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX5P50542 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX5P50542 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX5P50542 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PEX5P50542 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PEX5P50542 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PEX5P50542 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PEX5P50542 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PEX5P50542 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX5P50542 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX5P50542 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX5P50542 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX5P50542 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX5P50542 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX5P50542 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PEX5P50542 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PEX5P50542 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PEX5P50542 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PEX5P50542 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX5P50542 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX5P50542 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX5P50542 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX5P50542 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX5P50542 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PEX5P50542 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PEX5P50542 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PEX5P50542 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms