Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSK3BP49841 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GSK3BP49841 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSK3BP49841 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSK3BP49841 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms