Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CX3CR1P49238 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CX3CR1P49238 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CX3CR1P49238 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CX3CR1P49238 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CX3CR1P49238 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CX3CR1P49238 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms