Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSNK1DP48730 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSNK1DP48730 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSNK1DP48730 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSNK1DP48730 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSNK1DP48730 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSNK1DP48730 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms