Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTDSS1P48651 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1P48651 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTDSS1P48651 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1P48651 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTDSS1P48651 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms