Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL29P47914 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL29P47914 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL29P47914 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL29P47914 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL29P47914 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL29P47914 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL29P47914 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL29P47914 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL29P47914 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL29P47914 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL29P47914 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL29P47914 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL29P47914 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL29P47914 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL29P47914 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL29P47914 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL29P47914 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL29P47914 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL29P47914 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL29P47914 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL29P47914 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL29P47914 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL29P47914 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL29P47914 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL29P47914 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL29P47914 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL29P47914 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL29P47914 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL29P47914 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL29P47914 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPL29P47914 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL29P47914 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL29P47914 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL29P47914 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL29P47914 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL29P47914 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL29P47914 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL29P47914 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL29P47914 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL29P47914 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL29P47914 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL29P47914 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL29P47914 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL29P47914 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL29P47914 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL29P47914 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL29P47914 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL29P47914 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL29P47914 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL29P47914 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL29P47914 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL29P47914 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL29P47914 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL29P47914 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL29P47914 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL29P47914 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL29P47914 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL29P47914 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL29P47914 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL29P47914 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL29P47914 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL29P47914 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL29P47914 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL29P47914 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL29P47914 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL29P47914 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL29P47914 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL29P47914 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL29P47914 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL29P47914 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL29P47914 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL29P47914 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL29P47914 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL29P47914 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL29P47914 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL29P47914 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL29P47914 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL29P47914 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL29P47914 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL29P47914 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL29P47914 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL29P47914 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL29P47914 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL29P47914 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL29P47914 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL29P47914 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL29P47914 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL29P47914 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL29P47914 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL29P47914 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL29P47914 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL29P47914 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL29P47914 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms