Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCTRP47872 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCTRP47872 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCTRP47872 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCTRP47872 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCTRP47872 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCTRP47872 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCTRP47872 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCTRP47872 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCTRP47872 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCTRP47872 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCTRP47872 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCTRP47872 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCTRP47872 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCTRP47872 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCTRP47872 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCTRP47872 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCTRP47872 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCTRP47872 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCTRP47872 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCTRP47872 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCTRP47872 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCTRP47872 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCTRP47872 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCTRP47872 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCTRP47872 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCTRP47872 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCTRP47872 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCTRP47872 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCTRP47872 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCTRP47872 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCTRP47872 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCTRP47872 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCTRP47872 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCTRP47872 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCTRP47872 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCTRP47872 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCTRP47872 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCTRP47872 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCTRP47872 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCTRP47872 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCTRP47872 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCTRP47872 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCTRP47872 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCTRP47872 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCTRP47872 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCTRP47872 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCTRP47872 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCTRP47872 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCTRP47872 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCTRP47872 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCTRP47872 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCTRP47872 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCTRP47872 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCTRP47872 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCTRP47872 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCTRP47872 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCTRP47872 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCTRP47872 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCTRP47872 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCTRP47872 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCTRP47872 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCTRP47872 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCTRP47872 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCTRP47872 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCTRP47872 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCTRP47872 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCTRP47872 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCTRP47872 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCTRP47872 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCTRP47872 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCTRP47872 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCTRP47872 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCTRP47872 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCTRP47872 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCTRP47872 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCTRP47872 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCTRP47872 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCTRP47872 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCTRP47872 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCTRP47872 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCTRP47872 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCTRP47872 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCTRP47872 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCTRP47872 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCTRP47872 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCTRP47872 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCTRP47872 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCTRP47872 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCTRP47872 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCTRP47872 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCTRP47872 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCTRP47872 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms