Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEDD4P46934 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEDD4P46934 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEDD4P46934 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NEDD4P46934 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEDD4P46934 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEDD4P46934 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD4P46934 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms