Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA4P43681 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHRNA4P43681 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA4P43681 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA4P43681 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA4P43681 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA4P43681 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA4P43681 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA4P43681 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA4P43681 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms