Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NR4A2P43354 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A2P43354 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A2P43354 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A2P43354 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms