Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGIRP43119 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGIRP43119 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGIRP43119 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGIRP43119 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGIRP43119 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGIRP43119 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms