Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A1P43005 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A1P43005 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A1P43005 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A1P43005 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A1P43005 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A1P43005 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A1P43005 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A1P43005 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC1A1P43005 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A1P43005 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A1P43005 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC1A1P43005 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC1A1P43005 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms