Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP2P42575 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP2P42575 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP2P42575 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP2P42575 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP2P42575 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP2P42575 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP2P42575 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP2P42575 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP2P42575 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP2P42575 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP2P42575 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP2P42575 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP2P42575 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP2P42575 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP2P42575 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP2P42575 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP2P42575 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP2P42575 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP2P42575 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP2P42575 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP2P42575 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP2P42575 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP2P42575 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP2P42575 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP2P42575 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP2P42575 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP2P42575 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP2P42575 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP2P42575 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP2P42575 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP2P42575 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP2P42575 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP2P42575 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP2P42575 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP2P42575 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP2P42575 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP2P42575 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP2P42575 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP2P42575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP2P42575 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP2P42575 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP2P42575 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP2P42575 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP2P42575 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP2P42575 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP2P42575 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP2P42575 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP2P42575 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP2P42575 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP2P42575 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP2P42575 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP2P42575 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP2P42575 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP2P42575 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP2P42575 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP2P42575 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP2P42575 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP2P42575 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP2P42575 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP2P42575 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP2P42575 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP2P42575 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP2P42575 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP2P42575 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP2P42575 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP2P42575 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP2P42575 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP2P42575 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP2P42575 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP2P42575 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP2P42575 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP2P42575 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP2P42575 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP2P42575 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP2P42575 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP2P42575 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP2P42575 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP2P42575 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP2P42575 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP2P42575 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP2P42575 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP2P42575 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP2P42575 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP2P42575 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP2P42575 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP2P42575 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP2P42575 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP2P42575 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP2P42575 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP2P42575 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP2P42575 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP2P42575 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP2P42575 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP2P42575 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP2P42575 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP2P42575 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP2P42575 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP2P42575 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP2P42575 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms