Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CBP42338 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CBP42338 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CBP42338 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CBP42338 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms