Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIA3P42263 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIA3P42263 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIA3P42263 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIA3P42263 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA3P42263 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA3P42263 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms