Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A3P40879 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC26A3P40879 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A3P40879 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC26A3P40879 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC26A3P40879 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC26A3P40879 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms