Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH1P40692 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH1P40692 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MLH1P40692 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH1P40692 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MLH1P40692 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MLH1P40692 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH1P40692 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MLH1P40692 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH1P40692 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MLH1P40692 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MLH1P40692 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH1P40692 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH1P40692 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH1P40692 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH1P40692 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH1P40692 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH1P40692 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH1P40692 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH1P40692 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH1P40692 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH1P40692 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH1P40692 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH1P40692 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH1P40692 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH1P40692 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MLH1P40692 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH1P40692 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH1P40692 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH1P40692 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MLH1P40692 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH1P40692 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH1P40692 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MLH1P40692 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH1P40692 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH1P40692 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MLH1P40692 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH1P40692 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH1P40692 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH1P40692 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MLH1P40692 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH1P40692 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MLH1P40692 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH1P40692 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH1P40692 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH1P40692 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH1P40692 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH1P40692 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH1P40692 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH1P40692 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH1P40692 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH1P40692 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH1P40692 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH1P40692 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH1P40692 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MLH1P40692 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MLH1P40692 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH1P40692 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH1P40692 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH1P40692 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH1P40692 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH1P40692 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH1P40692 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH1P40692 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH1P40692 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH1P40692 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH1P40692 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH1P40692 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH1P40692 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH1P40692 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH1P40692 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH1P40692 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH1P40692 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH1P40692 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH1P40692 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH1P40692 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH1P40692 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH1P40692 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH1P40692 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH1P40692 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH1P40692 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH1P40692 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH1P40692 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH1P40692 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH1P40692 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH1P40692 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH1P40692 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH1P40692 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH1P40692 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH1P40692 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH1P40692 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms