Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL3P39023 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL3P39023 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL3P39023 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL3P39023 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL3P39023 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL3P39023 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL3P39023 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL3P39023 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL3P39023 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL3P39023 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL3P39023 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL3P39023 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL3P39023 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL3P39023 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3P39023 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3P39023 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3P39023 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL3P39023 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL3P39023 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL3P39023 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL3P39023 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL3P39023 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL3P39023 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL3P39023 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL3P39023 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL3P39023 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL3P39023 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL3P39023 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL3P39023 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL3P39023 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL3P39023 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL3P39023 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL3P39023 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3P39023 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3P39023 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3P39023 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3P39023 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3P39023 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3P39023 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL3P39023 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL3P39023 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL3P39023 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL3P39023 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL3P39023 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL3P39023 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL3P39023 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL3P39023 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL3P39023 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL3P39023 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL3P39023 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL3P39023 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL3P39023 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL3P39023 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL3P39023 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL3P39023 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL3P39023 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL3P39023 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL3P39023 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL3P39023 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL3P39023 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL3P39023 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPL3P39023 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL3P39023 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL3P39023 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL3P39023 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL3P39023 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL3P39023 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL3P39023 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL3P39023 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL3P39023 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL3P39023 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL3P39023 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL3P39023 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL3P39023 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL3P39023 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL3P39023 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL3P39023 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL3P39023 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL3P39023 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL3P39023 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL3P39023 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL3P39023 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL3P39023 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3P39023 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3P39023 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3P39023 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3P39023 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3P39023 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3P39023 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3P39023 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3P39023 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3P39023 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3P39023 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3P39023 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3P39023 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3P39023 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL3P39023 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL3P39023 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL3P39023 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms