Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ETFBP38117 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ETFBP38117 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ETFBP38117 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ETFBP38117 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ETFBP38117 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ETFBP38117 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ETFBP38117 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ETFBP38117 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ETFBP38117 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ETFBP38117 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ETFBP38117 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ETFBP38117 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ETFBP38117 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ETFBP38117 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ETFBP38117 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ETFBP38117 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ETFBP38117 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ETFBP38117 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ETFBP38117 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ETFBP38117 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ETFBP38117 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ETFBP38117 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ETFBP38117 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ETFBP38117 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ETFBP38117 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ETFBP38117 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ETFBP38117 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ETFBP38117 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ETFBP38117 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ETFBP38117 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ETFBP38117 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ETFBP38117 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ETFBP38117 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ETFBP38117 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ETFBP38117 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ETFBP38117 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ETFBP38117 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ETFBP38117 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ETFBP38117 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ETFBP38117 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ETFBP38117 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ETFBP38117 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ETFBP38117 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ETFBP38117 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ETFBP38117 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ETFBP38117 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ETFBP38117 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ETFBP38117 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ETFBP38117 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ETFBP38117 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ETFBP38117 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ETFBP38117 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ETFBP38117 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ETFBP38117 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ETFBP38117 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ETFBP38117 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ETFBP38117 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ETFBP38117 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ETFBP38117 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ETFBP38117 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ETFBP38117 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ETFBP38117 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ETFBP38117 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ETFBP38117 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ETFBP38117 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ETFBP38117 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ETFBP38117 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ETFBP38117 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ETFBP38117 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ETFBP38117 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ETFBP38117 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ETFBP38117 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ETFBP38117 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ETFBP38117 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ETFBP38117 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ETFBP38117 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ETFBP38117 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ETFBP38117 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ETFBP38117 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ETFBP38117 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ETFBP38117 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ETFBP38117 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ETFBP38117 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ETFBP38117 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ETFBP38117 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ETFBP38117 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ETFBP38117 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ETFBP38117 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ETFBP38117 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ETFBP38117 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ETFBP38117 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ETFBP38117 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ETFBP38117 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ETFBP38117 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ETFBP38117 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ETFBP38117 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ETFBP38117 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ETFBP38117 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ETFBP38117 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms