Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOX5P35711 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOX5P35711 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX5P35711 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX5P35711 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX5P35711 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOX5P35711 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOX5P35711 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOX5P35711 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOX5P35711 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX5P35711 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX5P35711 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOX5P35711 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOX5P35711 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOX5P35711 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOX5P35711 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOX5P35711 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX5P35711 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX5P35711 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX5P35711 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX5P35711 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX5P35711 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX5P35711 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX5P35711 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX5P35711 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX5P35711 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SOX5P35711 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX5P35711 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOX5P35711 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOX5P35711 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOX5P35711 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX5P35711 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX5P35711 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX5P35711 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX5P35711 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX5P35711 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX5P35711 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX5P35711 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX5P35711 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX5P35711 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX5P35711 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX5P35711 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX5P35711 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX5P35711 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX5P35711 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX5P35711 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX5P35711 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX5P35711 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX5P35711 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX5P35711 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX5P35711 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX5P35711 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX5P35711 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX5P35711 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX5P35711 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX5P35711 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX5P35711 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX5P35711 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOX5P35711 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOX5P35711 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOX5P35711 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX5P35711 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX5P35711 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX5P35711 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX5P35711 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOX5P35711 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX5P35711 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX5P35711 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX5P35711 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX5P35711 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX5P35711 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX5P35711 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOX5P35711 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX5P35711 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX5P35711 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX5P35711 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX5P35711 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SOX5P35711 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SOX5P35711 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX5P35711 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX5P35711 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX5P35711 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX5P35711 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX5P35711 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX5P35711 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX5P35711 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX5P35711 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX5P35711 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms