Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS4P35443 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS4P35443 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS4P35443 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS4P35443 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS4P35443 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS4P35443 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS4P35443 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS4P35443 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS4P35443 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS4P35443 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THBS4P35443 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THBS4P35443 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THBS4P35443 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THBS4P35443 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS4P35443 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS4P35443 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS4P35443 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS4P35443 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS4P35443 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS4P35443 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS4P35443 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS4P35443 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS4P35443 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THBS4P35443 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS4P35443 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS4P35443 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS4P35443 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS4P35443 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THBS4P35443 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS4P35443 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS4P35443 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS4P35443 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS4P35443 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS4P35443 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THBS4P35443 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THBS4P35443 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS4P35443 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS4P35443 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS4P35443 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS4P35443 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS4P35443 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THBS4P35443 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS4P35443 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS4P35443 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS4P35443 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS4P35443 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THBS4P35443 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS4P35443 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS4P35443 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS4P35443 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS4P35443 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS4P35443 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS4P35443 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS4P35443 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS4P35443 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS4P35443 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS4P35443 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS4P35443 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS4P35443 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS4P35443 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS4P35443 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS4P35443 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS4P35443 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS4P35443 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS4P35443 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THBS4P35443 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS4P35443 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS4P35443 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS4P35443 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS4P35443 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THBS4P35443 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS4P35443 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS4P35443 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS4P35443 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS4P35443 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THBS4P35443 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THBS4P35443 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS4P35443 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS4P35443 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS4P35443 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS4P35443 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms