Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCVRNP35243 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCVRNP35243 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCVRNP35243 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms