Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN7P35236 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN7P35236 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN7P35236 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPN7P35236 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN7P35236 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN7P35236 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms