Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 ODC1YPL134C 933 nt11.83□□□□□ -0.52
SPT7P35177 DLD3YEL071W 1491 nt11.82□□□□□ -0.52
SPT7P35177 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.82□□□□□ -0.52
SPT7P35177 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.82□□□□□ -0.52
SPT7P35177 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.82□□□□□ -0.52
SPT7P35177 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.82□□□□□ -0.52
SPT7P35177 ITR2YOL103W 1830 nt11.81□□□□□ -0.52
SPT7P35177 ERG13YML126C 1476 nt11.79□□□□□ -0.52
SPT7P35177 TMA23YMR269W 636 nt11.79□□□□□ -0.52
SPT7P35177 SAC7YDR389W 1965 nt11.78□□□□□ -0.52
SPT7P35177 YIA6YIL006W 1122 nt11.78□□□□□ -0.52
SPT7P35177 YLR046CYLR046C 813 nt11.78□□□□□ -0.52
SPT7P35177 TIP1YBR067C 633 nt11.77□□□□□ -0.53
SPT7P35177 MAE1YKL029C 2010 nt11.77□□□□□ -0.53
SPT7P35177 TAF13YML098W 504 nt11.76□□□□□ -0.53
SPT7P35177 CCT5YJR064W 1689 nt11.71□□□□□ -0.53
SPT7P35177 SNZ1YMR096W 894 nt11.71□□□□□ -0.53
SPT7P35177 ENT4YLL038C 744 nt11.69□□□□□ -0.54
SPT7P35177 DMA2YNL116W 1569 nt11.68□□□□□ -0.54
SPT7P35177 PAR32YDL173W 888 nt11.67□□□□□ -0.54
SPT7P35177 IMO32YGR031W 1029 nt11.67□□□□□ -0.54
SPT7P35177 RIB7YBR153W 735 nt11.67□□□□□ -0.54
SPT7P35177 THI72YOR192C 1800 nt11.67□□□□□ -0.54
SPT7P35177 SFP1YLR403W 2052 nt11.67□□□□□ -0.54
SPT7P35177 ACO2YJL200C 2370 nt11.65□□□□□ -0.54
SPT7P35177 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.64□□□□□ -0.55
SPT7P35177 PSD1YNL169C 1503 nt11.63□□□□□ -0.55
SPT7P35177 RRT8YOL048C 1029 nt11.62□□□□□ -0.55
SPT7P35177 DAK2YFL053W 1776 nt11.61□□□□□ -0.55
SPT7P35177 ELO1YJL196C 933 nt11.6□□□□□ -0.55
SPT7P35177 CWP2YKL096W-A 279 nt11.6□□□□□ -0.55
SPT7P35177 RPD3YNL330C 1302 nt11.6□□□□□ -0.55
SPT7P35177 YHR218WYHR218W 1812 nt11.6□□□□□ -0.55
SPT7P35177 MDM35YKL053C-A 261 nt11.59□□□□□ -0.55
SPT7P35177 VMA11YPL234C 495 nt11.59□□□□□ -0.55
SPT7P35177 POP2YNR052C 1302 nt11.58□□□□□ -0.56
SPT7P35177 ADE8YDR408C 645 nt11.58□□□□□ -0.56
SPT7P35177 OPI3YJR073C 621 nt11.58□□□□□ -0.56
SPT7P35177 YPR126CYPR126C 309 nt11.57□□□□□ -0.56
SPT7P35177 HXT10YFL011W 1641 nt11.56□□□□□ -0.56
SPT7P35177 NPP1YCR026C 2229 nt11.56□□□□□ -0.56
SPT7P35177 YMR262WYMR262W 942 nt11.56□□□□□ -0.56
SPT7P35177 DPL1YDR294C 1770 nt11.53□□□□□ -0.56
SPT7P35177 YNR064CYNR064C 873 nt11.53□□□□□ -0.56
SPT7P35177 MET2YNL277W 1461 nt11.52□□□□□ -0.57
SPT7P35177 SNX3YOR357C 489 nt11.52□□□□□ -0.57
SPT7P35177 SUV3YPL029W 2214 nt11.51□□□□□ -0.57
SPT7P35177 SFL1YOR140W 2301 nt11.51□□□□□ -0.57
SPT7P35177 GSF2YML048W 1212 nt11.51□□□□□ -0.57
SPT7P35177 YCP4YCR004C 744 nt11.5□□□□□ -0.57
SPT7P35177 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.5□□□□□ -0.57
SPT7P35177 TUB4YLR212C 1422 nt11.49□□□□□ -0.57
SPT7P35177 RPC31YNL151C 756 nt11.49□□□□□ -0.57
SPT7P35177 RIM2YBR192W 1134 nt11.47□□□□□ -0.57
SPT7P35177 YMR265CYMR265C 1386 nt11.47□□□□□ -0.57
SPT7P35177 POT1YIL160C 1254 nt11.45□□□□□ -0.58
SPT7P35177 CTI6YPL181W 1521 nt11.45□□□□□ -0.58
SPT7P35177 CYT1YOR065W 930 nt11.44□□□□□ -0.58
SPT7P35177 TVP23YDR084C 600 nt11.43□□□□□ -0.58
SPT7P35177 BUD20YLR074C 501 nt11.43□□□□□ -0.58
SPT7P35177 SPS100YHR139C 981 nt11.42□□□□□ -0.58
SPT7P35177 HAP5YOR358W 729 nt11.42□□□□□ -0.58
SPT7P35177 MHF1YOL086W-A 273 nt11.41□□□□□ -0.58
SPT7P35177 AGP3YFL055W 1677 nt11.41□□□□□ -0.58
SPT7P35177 YHL008CYHL008C 1884 nt11.41□□□□□ -0.58
SPT7P35177 CRC1YOR100C 984 nt11.4□□□□□ -0.58
SPT7P35177 LEU4YNL104C 1860 nt11.4□□□□□ -0.58
SPT7P35177 SAM50YNL026W 1455 nt11.4□□□□□ -0.59
SPT7P35177 SWT21YNL187W 1074 nt11.39□□□□□ -0.59
SPT7P35177 KEL3YPL263C 1956 nt11.39□□□□□ -0.59
SPT7P35177 MET1YKR069W 1782 nt11.38□□□□□ -0.59
SPT7P35177 IML3YBR107C 738 nt11.35□□□□□ -0.59
SPT7P35177 KRE1YNL322C 942 nt11.34□□□□□ -0.59
SPT7P35177 GID7YCL039W 2238 nt11.33□□□□□ -0.6
SPT7P35177 HMG2YLR450W 3138 nt11.33□□□□□ -0.6
SPT7P35177 YKL053WYKL053W 375 nt11.33□□□□□ -0.6
SPT7P35177 ABZ2YMR289W 1125 nt11.33□□□□□ -0.6
SPT7P35177 TPO4YOR273C 1980 nt11.32□□□□□ -0.6
SPT7P35177 YCR025CYCR025C 411 nt11.3□□□□□ -0.6
SPT7P35177 APS2YJR058C 444 nt11.3□□□□□ -0.6
SPT7P35177 NPP2YEL016C 1482 nt11.29□□□□□ -0.6
SPT7P35177 KGD2YDR148C 1392 nt11.28□□□□□ -0.6
SPT7P35177 PCP1YGR101W 1041 nt11.27□□□□□ -0.61
SPT7P35177 KRR1YCL059C 951 nt11.26□□□□□ -0.61
SPT7P35177 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt11.26□□□□□ -0.61
SPT7P35177 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt11.26□□□□□ -0.61
SPT7P35177 RPN14YGL004C 1254 nt11.26□□□□□ -0.61
SPT7P35177 AMF1YOR378W 1548 nt11.26□□□□□ -0.61
SPT7P35177 IGD1YFR017C 588 nt11.25□□□□□ -0.61
SPT7P35177 FET5YFL041W 1869 nt11.24□□□□□ -0.61
SPT7P35177 YDR467CYDR467C 327 nt11.24□□□□□ -0.61
SPT7P35177 TPC1YGR096W 945 nt11.23□□□□□ -0.61
SPT7P35177 ENO2YHR174W 1314 nt11.22□□□□□ -0.61
SPT7P35177 NIF3YGL221C 867 nt11.21□□□□□ -0.61
SPT7P35177 THI3YDL080C 1830 nt11.2□□□□□ -0.62
SPT7P35177 SAN1YDR143C 1833 nt11.2□□□□□ -0.62
SPT7P35177 snR31snR31 225 nt11.19□□□□□ -0.62
SPT7P35177 NBA1YOL070C 1506 nt11.18□□□□□ -0.62
SPT7P35177 INH1YDL181W 258 nt11.17□□□□□ -0.62
SPT7P35177 GPM1YKL152C 744 nt11.17□□□□□ -0.62
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