Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CLIP1P30622 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CLIP1P30622 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CLIP1P30622 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CLIP1P30622 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CLIP1P30622 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CLIP1P30622 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CLIP1P30622 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CLIP1P30622 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CLIP1P30622 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CLIP1P30622 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CLIP1P30622 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CLIP1P30622 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CLIP1P30622 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CLIP1P30622 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CLIP1P30622 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CLIP1P30622 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CLIP1P30622 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
CLIP1P30622 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
CLIP1P30622 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CLIP1P30622 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CLIP1P30622 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CLIP1P30622 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CLIP1P30622 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms