Protein–RNA interactions for Protein: P30154

PPP2R1B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R1BP30154 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R1BP30154 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP2R1BP30154 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R1BP30154 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R1BP30154 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms