Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHS1P30084 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHS1P30084 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECHS1P30084 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ECHS1P30084 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECHS1P30084 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms