Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNGA1P29973 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGA1P29973 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNGA1P29973 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNGA1P29973 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNGA1P29973 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms