Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERPINB3P29508 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERPINB3P29508 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERPINB3P29508 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERPINB3P29508 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERPINB3P29508 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERPINB3P29508 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms