Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN6P29350 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN6P29350 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN6P29350 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN6P29350 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN6P29350 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms