Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARSP26640 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARSP26640 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARSP26640 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VARSP26640 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARSP26640 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARSP26640 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VARSP26640 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VARSP26640 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VARSP26640 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VARSP26640 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VARSP26640 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VARSP26640 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VARSP26640 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARSP26640 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARSP26640 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARSP26640 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARSP26640 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VARSP26640 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARSP26640 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARSP26640 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARSP26640 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VARSP26640 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARSP26640 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VARSP26640 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VARSP26640 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARSP26640 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARSP26640 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARSP26640 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VARSP26640 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARSP26640 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARSP26640 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VARSP26640 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VARSP26640 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARSP26640 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARSP26640 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARSP26640 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VARSP26640 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARSP26640 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VARSP26640 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VARSP26640 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VARSP26640 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VARSP26640 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VARSP26640 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VARSP26640 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VARSP26640 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VARSP26640 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VARSP26640 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VARSP26640 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VARSP26640 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VARSP26640 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VARSP26640 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VARSP26640 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VARSP26640 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VARSP26640 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VARSP26640 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VARSP26640 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VARSP26640 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VARSP26640 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VARSP26640 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VARSP26640 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VARSP26640 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VARSP26640 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VARSP26640 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VARSP26640 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VARSP26640 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VARSP26640 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VARSP26640 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VARSP26640 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VARSP26640 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VARSP26640 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VARSP26640 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VARSP26640 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VARSP26640 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VARSP26640 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VARSP26640 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VARSP26640 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VARSP26640 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VARSP26640 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VARSP26640 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VARSP26640 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VARSP26640 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VARSP26640 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VARSP26640 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VARSP26640 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VARSP26640 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VARSP26640 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VARSP26640 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VARSP26640 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VARSP26640 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARSP26640 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARSP26640 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARSP26640 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms