Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTX3P26022 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTX3P26022 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTX3P26022 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTX3P26022 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTX3P26022 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTX3P26022 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTX3P26022 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTX3P26022 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTX3P26022 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTX3P26022 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTX3P26022 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTX3P26022 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTX3P26022 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTX3P26022 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTX3P26022 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTX3P26022 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTX3P26022 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTX3P26022 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTX3P26022 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTX3P26022 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTX3P26022 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTX3P26022 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTX3P26022 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTX3P26022 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTX3P26022 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTX3P26022 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTX3P26022 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTX3P26022 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTX3P26022 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTX3P26022 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTX3P26022 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTX3P26022 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTX3P26022 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTX3P26022 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTX3P26022 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTX3P26022 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTX3P26022 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTX3P26022 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTX3P26022 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTX3P26022 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTX3P26022 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTX3P26022 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTX3P26022 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTX3P26022 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTX3P26022 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTX3P26022 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTX3P26022 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTX3P26022 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTX3P26022 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTX3P26022 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTX3P26022 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTX3P26022 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTX3P26022 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX3P26022 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX3P26022 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX3P26022 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX3P26022 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTX3P26022 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTX3P26022 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTX3P26022 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX3P26022 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX3P26022 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX3P26022 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX3P26022 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX3P26022 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTX3P26022 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTX3P26022 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTX3P26022 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTX3P26022 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTX3P26022 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTX3P26022 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTX3P26022 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTX3P26022 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTX3P26022 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTX3P26022 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTX3P26022 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTX3P26022 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTX3P26022 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTX3P26022 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTX3P26022 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTX3P26022 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTX3P26022 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTX3P26022 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTX3P26022 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTX3P26022 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTX3P26022 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTX3P26022 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTX3P26022 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTX3P26022 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTX3P26022 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTX3P26022 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms