Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO1P25800 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO1P25800 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO1P25800 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO1P25800 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO1P25800 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO1P25800 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO1P25800 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO1P25800 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO1P25800 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO1P25800 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO1P25800 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO1P25800 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO1P25800 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO1P25800 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO1P25800 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO1P25800 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO1P25800 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO1P25800 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO1P25800 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO1P25800 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO1P25800 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO1P25800 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO1P25800 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO1P25800 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO1P25800 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO1P25800 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO1P25800 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO1P25800 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO1P25800 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO1P25800 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO1P25800 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO1P25800 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO1P25800 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO1P25800 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO1P25800 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO1P25800 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO1P25800 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO1P25800 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO1P25800 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO1P25800 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO1P25800 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO1P25800 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO1P25800 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO1P25800 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO1P25800 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO1P25800 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO1P25800 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO1P25800 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO1P25800 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO1P25800 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO1P25800 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO1P25800 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO1P25800 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO1P25800 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO1P25800 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO1P25800 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO1P25800 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO1P25800 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO1P25800 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO1P25800 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO1P25800 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO1P25800 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO1P25800 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO1P25800 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO1P25800 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO1P25800 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO1P25800 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO1P25800 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO1P25800 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO1P25800 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO1P25800 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO1P25800 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO1P25800 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO1P25800 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO1P25800 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO1P25800 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMO1P25800 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO1P25800 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO1P25800 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMO1P25800 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO1P25800 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO1P25800 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMO1P25800 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO1P25800 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO1P25800 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMO1P25800 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMO1P25800 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO1P25800 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO1P25800 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMO1P25800 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO1P25800 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO1P25800 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO1P25800 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO1P25800 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO1P25800 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO1P25800 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO1P25800 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO1P25800 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO1P25800 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms