Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD2P25440 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD2P25440 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD2P25440 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD2P25440 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD2P25440 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD2P25440 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD2P25440 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD2P25440 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD2P25440 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD2P25440 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD2P25440 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD2P25440 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD2P25440 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD2P25440 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD2P25440 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD2P25440 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD2P25440 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD2P25440 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD2P25440 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD2P25440 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD2P25440 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD2P25440 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD2P25440 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD2P25440 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD2P25440 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD2P25440 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD2P25440 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD2P25440 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD2P25440 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD2P25440 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD2P25440 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD2P25440 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD2P25440 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD2P25440 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD2P25440 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD2P25440 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD2P25440 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD2P25440 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD2P25440 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD2P25440 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD2P25440 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD2P25440 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD2P25440 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD2P25440 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD2P25440 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD2P25440 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD2P25440 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD2P25440 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD2P25440 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD2P25440 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD2P25440 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD2P25440 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD2P25440 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD2P25440 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD2P25440 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD2P25440 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD2P25440 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD2P25440 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD2P25440 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD2P25440 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD2P25440 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD2P25440 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BRD2P25440 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD2P25440 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD2P25440 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD2P25440 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD2P25440 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD2P25440 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD2P25440 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD2P25440 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD2P25440 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD2P25440 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD2P25440 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD2P25440 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD2P25440 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD2P25440 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD2P25440 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD2P25440 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD2P25440 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BRD2P25440 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD2P25440 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD2P25440 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD2P25440 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD2P25440 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD2P25440 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms