Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR1P25024 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR1P25024 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR1P25024 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms