Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFL1P23528 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFL1P23528 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFL1P23528 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFL1P23528 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFL1P23528 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFL1P23528 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFL1P23528 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFL1P23528 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFL1P23528 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFL1P23528 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFL1P23528 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFL1P23528 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFL1P23528 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFL1P23528 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFL1P23528 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFL1P23528 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFL1P23528 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFL1P23528 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFL1P23528 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFL1P23528 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFL1P23528 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFL1P23528 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFL1P23528 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFL1P23528 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFL1P23528 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFL1P23528 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFL1P23528 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFL1P23528 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFL1P23528 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFL1P23528 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFL1P23528 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFL1P23528 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFL1P23528 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFL1P23528 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFL1P23528 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFL1P23528 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFL1P23528 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFL1P23528 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFL1P23528 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFL1P23528 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFL1P23528 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFL1P23528 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFL1P23528 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFL1P23528 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFL1P23528 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFL1P23528 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms