Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLRA1P23415 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLRA1P23415 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLRA1P23415 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLRA1P23415 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms