Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKACBP22694 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACBP22694 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKACBP22694 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKACBP22694 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKACBP22694 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms