Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P22392 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P22392 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P22392 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P22392 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME2P22392 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P22392 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P22392 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P22392 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P22392 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME2P22392 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME2P22392 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME2P22392 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME2P22392 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME2P22392 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME2P22392 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME2P22392 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME2P22392 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME2P22392 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME2P22392 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME2P22392 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME2P22392 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME2P22392 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME2P22392 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME2P22392 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NME2P22392 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME2P22392 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P22392 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P22392 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P22392 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P22392 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P22392 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P22392 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P22392 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P22392 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P22392 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P22392 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P22392 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME2P22392 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME2P22392 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME2P22392 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME2P22392 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P22392 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P22392 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P22392 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P22392 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P22392 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NME2P22392 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P22392 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P22392 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P22392 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P22392 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P22392 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P22392 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME2P22392 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME2P22392 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME2P22392 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME2P22392 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NME2P22392 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NME2P22392 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME2P22392 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P22392 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P22392 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P22392 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P22392 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P22392 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P22392 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P22392 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P22392 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P22392 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P22392 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME2P22392 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME2P22392 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME2P22392 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME2P22392 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P22392 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P22392 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P22392 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P22392 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P22392 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P22392 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME2P22392 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME2P22392 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME2P22392 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P22392 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P22392 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P22392 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P22392 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P22392 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms