Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCL3P20749 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCL3P20749 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCL3P20749 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCL3P20749 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCL3P20749 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCL3P20749 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCL3P20749 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCL3P20749 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BCL3P20749 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCL3P20749 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BCL3P20749 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL3P20749 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL3P20749 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL3P20749 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL3P20749 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL3P20749 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL3P20749 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL3P20749 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL3P20749 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL3P20749 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL3P20749 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL3P20749 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL3P20749 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL3P20749 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL3P20749 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL3P20749 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL3P20749 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL3P20749 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL3P20749 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL3P20749 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL3P20749 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL3P20749 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL3P20749 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL3P20749 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL3P20749 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL3P20749 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL3P20749 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL3P20749 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL3P20749 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL3P20749 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL3P20749 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL3P20749 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCL3P20749 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCL3P20749 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCL3P20749 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCL3P20749 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCL3P20749 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL3P20749 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL3P20749 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL3P20749 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL3P20749 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL3P20749 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL3P20749 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL3P20749 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL3P20749 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL3P20749 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL3P20749 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL3P20749 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL3P20749 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL3P20749 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL3P20749 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL3P20749 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL3P20749 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL3P20749 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCL3P20749 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL3P20749 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCL3P20749 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL3P20749 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCL3P20749 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCL3P20749 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCL3P20749 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL3P20749 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL3P20749 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL3P20749 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL3P20749 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL3P20749 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCL3P20749 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCL3P20749 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL3P20749 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL3P20749 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL3P20749 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL3P20749 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL3P20749 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL3P20749 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL3P20749 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL3P20749 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL3P20749 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL3P20749 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL3P20749 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL3P20749 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL3P20749 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCL3P20749 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL3P20749 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms