Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP4AP20648 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP4AP20648 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP4AP20648 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP4AP20648 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP4AP20648 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP4AP20648 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP4AP20648 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP4AP20648 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP4AP20648 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATP4AP20648 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP4AP20648 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP4AP20648 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP4AP20648 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms