Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR1D1P20393 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1D1P20393 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1D1P20393 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR1D1P20393 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1D1P20393 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D1P20393 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms